除系统自带的远程桌面外，许多优秀的第三方远程控制软件也能实现远程桌面连接，且往往在连接的简易性和操作的功能性等方面，较之自带的远程桌面有一定的优势。常见的第三方软件如国产免费软件网络人(Netman)远程控制软件、QQ远程协助，国外知名的Teamviewer、PCanywhere等，都是非常优秀的远程控制软件。这些第三方软件，在连接速度上，比系统自带的远程桌面差上一些，但随着技术的发展，这些差距已经越来越小。
网络人远程控制软件
网络人(Netman)远程控制软件是一款非常优秀的国产免费软件，通过输入对方的IP和控制密码，或者注册固定ID实现远程桌面连接。软件使用 UDP协议穿透内网，不用做端口映射，用户就能在任何一台可以上网的电脑都连接远端电脑，不用担心内网IP和防火墙设置等问题，在连接的快捷性上要比系统远程桌面连接出色许多。另外，软件除了实现桌面连接、远程操作等功能外，还有许多系统远程桌面没有的特色功能，网络人企业版还现实了同时连接多个电脑屏幕的功能，方便企业用户远程管理公司电脑。
主要功能
(1)实现隐蔽监控：隐藏被控端网络人程序图标及相关提示，被控时不被发觉。
(2)远程访问桌面：同步查看远程电脑的屏幕，能使用本地鼠标键盘如操作本机一样操作远程电脑。
(3)可对远程电脑屏幕进行拍照或录像。控制端只需点击功能键便可以切换双方身份。应用于远程电脑维护、远程技术支持、远程协助等。
(4)远程文件管理：上传、下载文件，远程修改、运行文件，实现连接双方电脑的资源共享，用于远程办公等。
(5)远程开启视频：开启远端电脑摄像头，进行语音视频聊天。支持视频录制，可远程旋转带有旋转功能的摄像头，用于家庭安全监控等。
(6)远程命令控制：远程开机(需配合使用网络人电脑控制器硬件)、远程关机、远程重启、远程注销、锁定本地或远端电脑的鼠标键盘等。
(7)文字聊天。
Teamviewer
TeamViewer和网络人远程控制软件一样，是一个能在任何防火墙和NAT代理的后台用于远程控制，桌面共享和文件传输的简单且快速的解决方案。为了连接到另一台计算机，只需要在两台计算机上同时运行 TeamViewer 即可，而不需要进行安装(也可以选择安装，安装后可以设置开机运行)。该软件第一次启动在两台计算机上自动生成伙伴 ID。只需要输入你的伙伴的ID到TeamViewer，然后就会立即建立起连接。
如果您回到家后想连接控制在学校或公司里自己的电脑，很多人会想到使用Windows远程桌面连接。一般情况下，它无疑是最好的方案了，但如果你要连接的电脑位于内网，即路由器(Router)或防火墙后方(电脑是内部IP)，那样就必须在路由器上做一些设定端口映射之类的设置才有办法连上，而网管也不太可能帮您设定的。这时TeamViewer无疑就是最佳的解决方案了。
PCAnywhere是Symantec公司开发的一款优秀的远程控制软件，现在可以支持 Mac OS X，使用者将感受不同于以往的使用经验，从更多不同的系统存取其它系统。如同往常，使用者也可以使用 Microsoft WindowsR、Linux 或 MicrosoftR Pocket PC 系统连接至 pcAnywhere 被控端。即使主控端使用者未安装 pcAnywhere 远端软体，也可透过一般的网页浏览器及具有 Java 技术的 pcAnywhere Web Remote 软体，连接至被控端。所以在跨平台方面，pcAnywhere较之windows系统自带的远程桌面连接有着非常大的优势。