Windows的关机程序在关机过程中将执行下述各项功能：完成所有磁盘写操作——清除磁盘缓存——执行关闭窗口程序关闭所有当前运行的程序——将所有保护模式的驱动程序转换成实模式。
引起Windows系统出现关机故障的主要原因有：选择的退出Windows时的声音文件损坏;不正确配置或损坏硬件;BIOS配置的设置不相容;在BIOS中的“高级电源管理”或“高级配置和电源接口”的设置不适当;没有在实模式下为视频卡分配一个IRQ;某一个程序或TSR程序可能没有正确地关闭;加载了一个不兼容的、损坏的或冲突的设备驱动程序等等。
电脑不能正常关机故障分析与解决：
1.退出Windows时的声音文件损坏
首先确定“退出Windows”声音文件是否已毁坏——打开“控制面板”，打开“声音”，将“退出Windows”声音取消。如果Windows正常关闭，则问题是由退出声音文件所引起的，要解决这一问题，可以从备份中恢复声音文件或者重新安装提供声音文件的程序，也可定义“退出Windows”为无声。
2.快速关机不正常
快速关机是Windows98中的新增功能，可以大大减少关机时间，但是该功能与某些硬件不兼容，可能会导致计算机停止响应。可运行“Msconfig”，在“高级”选项中禁用快速关机。如果计算机能正常关机，则说明硬件设备不兼容现象存在。
3.注意“高级电源管理”
此外计算机上的“高级电源管理(APM)”功能也可引起关机死机或黑屏问题。而要确定APM是否会引起关机问题，可打开“设备管理器”，打开“系统设备”。在“高级电源管理”中取消“启用电源管理”选择。如果计算机正常关机，则问题的原因可能在于APM。
4.启动即关机故障
大家经常遇到在Windows刚刚启动的时侯就显示“你可以安全地关闭计算机了”，或者启动时马上关机或关机时重新启动等故障。这类故障的原因一般来说是由于Wininit.exe或Vmm32.vxd文件的损坏所造成的。解决办法是重新从WINDOWS安装程序压缩包中调取这两个文件。放入 Windowssystem子目录下，将Vmm32.vxd改名为Vmm32.XXX进行备份，然后打开“系统工具”，选择“系统信息”——“工具”里的“系统文件检查器”，选择“从安装盘提取一个文件”，输入“Wininit.exe”或“Vmm32.vxd”。重复此步骤，以替换文件 Wininit.exe或Vmm32.vxd。
5.Config.sys或Autoexec.bat有问题
从安装盘提取一个文件，此外，可检查Config.sys文件或Autoexec.bat文件中是否存在冲突。用文本编辑器察看这两个文件的内容，看是否有多余的命令，也可以用“rem”来禁止某些语句的执行，逐步排除，直到发现有冲突的命令。
6.检查CMOS设置
CMOS设置不正确一样也会引起电脑关机问题，在电脑启动时可进入CMOS设置页面，重点检查CPU外频、电源管理、病毒检测、IRQ中断开闭、磁盘启动顺序等选项设置是否正确。具体设置方法你可参看你的主板说明书，其上面有很详细的设置说明，如果对其设置实在是不太懂，建议直接用厂家出厂默认设置既可。